Es una etnohistoriadora, historiadora del arte y académica estadounidense, especializada en arte precolombino, iconografía y códices de las civilizaciones mixteca y mexica, así como de otras del centro de México. Ha desarrollado un trabajo extenso en lo que se refiere a la escritura mexica, a su iconografía y a sus simbolismos. Ha sido profesora de historia del arte en la Universidad de Tulane desde 1994 y ostenta la cátedra Martha y Donald Robertson de arte de América Latina. Es también investigadora asociada en la misma universidad.
Trabajó como investigadora asociada en la propia Universidad de Texas, ahora en San Antonio. En 1980 Boone inició sus trabajos para la biblioteca de Dumbarton Oaks en Washington D.C. donde fue nombrada directora de Estudios precolombinos y conservadora de la Colección Precolombina. Desde 2006 pertenece al Consejo de asociados en estudios precolombinos de Dumbarton Oaks.
En 1995 Boone se trasladó a Nueva Orleans, Luisiana para asumir el profesorado en la Universidad de Tulane dando clases sobre historia e interpretación del arte mesoamericano, particularmente el mexica. Desde esa posición ha continuado la publicación de documentos sobre esos temas.
En 1990 Boone recibió la Orden del Águila Azteca, la más alta condecoración otorgada por el gobierno de México a un extranjero, por sus trabajos sobre las civilizaciones mesoamericanas.
En 2010 fue elegida presidente de la Sociedad Americana de Etnohistoria de los Estados Unidos.